More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4255 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1664  excinuclease ABC subunit C  63.15 
 
 
670 aa  817    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2889  excinuclease ABC subunit C  78.31 
 
 
731 aa  1137    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0288597  normal  0.314719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  70.33 
 
 
654 aa  944    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  80.26 
 
 
740 aa  1126    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  69.85 
 
 
663 aa  926    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  51.8 
 
 
598 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  61.14 
 
 
649 aa  835    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  93.57 
 
 
684 aa  1247    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
677 aa  1389    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0415  excinuclease ABC, C subunit  58.97 
 
 
620 aa  782    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1960  excinuclease ABC subunit C  60.12 
 
 
673 aa  800    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403452  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  54.1 
 
 
606 aa  688    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0423  excinuclease ABC, C subunit  58.26 
 
 
618 aa  769    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1739  excinuclease ABC subunit C  77.63 
 
 
742 aa  1128    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00965022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  62.56 
 
 
657 aa  823    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  61.49 
 
 
671 aa  800    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 
599 aa  676    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  60.95 
 
 
666 aa  825    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  77.81 
 
 
753 aa  1135    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  94.98 
 
 
674 aa  1286    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2877  excinuclease ABC subunit C  61.19 
 
 
650 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.776439  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  69.13 
 
 
673 aa  944    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  95.3 
 
 
681 aa  1276    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  69.09 
 
 
657 aa  931    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  59.17 
 
 
685 aa  796    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  63.16 
 
 
653 aa  824    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  93.27 
 
 
684 aa  1248    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  94.43 
 
 
682 aa  1269    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  95.3 
 
 
681 aa  1276    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  62.26 
 
 
657 aa  820    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  61.19 
 
 
692 aa  791    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  69.61 
 
 
657 aa  935    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  51.33 
 
 
605 aa  644    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  49.4 
 
 
603 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2829  excinuclease ABC subunit C  88.42 
 
 
747 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1779  excinuclease ABC subunit C  88.42 
 
 
747 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0552  excinuclease ABC subunit C  88.42 
 
 
749 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2456  excinuclease ABC subunit C  88.42 
 
 
747 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2824  excinuclease ABC subunit C  88.42 
 
 
747 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2884  excinuclease ABC subunit C  88.42 
 
 
749 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2769  excinuclease ABC subunit C  88.42 
 
 
747 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  47.98 
 
 
609 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 
611 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  44.55 
 
 
613 aa  548  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  44.71 
 
 
607 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  41.79 
 
 
599 aa  535  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  43.9 
 
 
612 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  43.72 
 
 
609 aa  536  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  45.6 
 
 
607 aa  535  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  43.26 
 
 
627 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  45.24 
 
 
607 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  43.11 
 
 
621 aa  528  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  44.35 
 
 
607 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  44.26 
 
 
607 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  44.11 
 
 
607 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  43.63 
 
 
619 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  42.88 
 
 
639 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 
618 aa  522  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  43.92 
 
 
607 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  44.21 
 
 
608 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  43.51 
 
 
618 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  43.3 
 
 
626 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  43.03 
 
 
607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 
618 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  43.47 
 
 
607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  43.2 
 
 
610 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  44.63 
 
 
585 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  44.02 
 
 
608 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 
610 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  43.2 
 
 
610 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  43.2 
 
 
610 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  43.05 
 
 
610 aa  514  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  41.47 
 
 
609 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 
610 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  42.46 
 
 
617 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  42.46 
 
 
610 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  43.2 
 
 
610 aa  515  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  42.6 
 
 
610 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  42.46 
 
 
617 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  42.18 
 
 
608 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  42.46 
 
 
610 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  42.6 
 
 
610 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  43.41 
 
 
614 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  42.6 
 
 
610 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  42.37 
 
 
609 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  43.88 
 
 
614 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  41.95 
 
 
610 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  44.23 
 
 
645 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  41.21 
 
 
608 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  42.46 
 
 
610 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
610 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  42.28 
 
 
609 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  41.15 
 
 
610 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  42.75 
 
 
607 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  40.8 
 
 
609 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  41.09 
 
 
609 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  43.23 
 
 
588 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  41.27 
 
 
609 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  41.25 
 
 
607 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  41.27 
 
 
609 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>