More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0851 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  79.52 
 
 		 674 aa  1127    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  80 
 
 		 682 aa  1117    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  67.38 
 
 		 654 aa  939    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0415  excinuclease ABC, C subunit  57.14 
 
 		 620 aa  770    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  57.31 
 
 		 692 aa  763    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  58.98 
 
 		 657 aa  806    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  78.53 
 
 		 684 aa  1105    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  66.01 
 
 		 663 aa  915    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1960  excinuclease ABC subunit C  57.06 
 
 		 673 aa  791    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2889  excinuclease ABC subunit C  85.04 
 
 		 731 aa  1214    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0288597  normal  0.314719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  80.11 
 
 		 677 aa  1131    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0423  excinuclease ABC, C subunit  56.52 
 
 		 618 aa  759    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  55.84 
 
 		 685 aa  771    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  58.76 
 
 		 653 aa  791    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  66.95 
 
 		 657 aa  935    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1739  excinuclease ABC subunit C  76.25 
 
 		 742 aa  1105    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00965022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  59.32 
 
 		 671 aa  790    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2877  excinuclease ABC subunit C  58.76 
 
 		 650 aa  793    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.776439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  58.82 
 
 		 666 aa  811    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  83.72 
 
 		 753 aa  1209    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  67.51 
 
 		 673 aa  931    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  80.25 
 
 		 681 aa  1119    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  58.98 
 
 		 657 aa  806    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  78.53 
 
 		 684 aa  1110    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  64.94 
 
 		 657 aa  942    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  80.25 
 
 		 681 aa  1119    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  58.28 
 
 		 649 aa  813    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 740 aa  1516    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1664  excinuclease ABC subunit C  58.5 
 
 		 670 aa  780    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  48.72 
 
 		 599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2829  excinuclease ABC subunit C  89.49 
 
 		 747 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2456  excinuclease ABC subunit C  89.49 
 
 		 747 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2824  excinuclease ABC subunit C  89.49 
 
 		 747 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0552  excinuclease ABC subunit C  89.49 
 
 		 749 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2884  excinuclease ABC subunit C  89.49 
 
 		 749 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2769  excinuclease ABC subunit C  89.49 
 
 		 747 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1779  excinuclease ABC subunit C  89.49 
 
 		 747 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  42.57 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  42.43 
 
 		 607 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  41.55 
 
 		 611 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  41.08 
 
 		 607 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  39.89 
 
 		 618 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 618 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  42.84 
 
 		 585 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  42.39 
 
 		 607 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  39.86 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  40.31 
 
 		 607 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  40.08 
 
 		 608 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 		 604 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  38.05 
 
 		 629 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 644 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 634 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  35.57 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  36.27 
 
 		 680 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 		 690 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 		 704 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 		 633 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 642 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 666 aa  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  60.82 
 
 		 605 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  58.28 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  63.41 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  35.09 
 
 		 623 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  35.04 
 
 		 680 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  59.51 
 
 		 598 aa  356  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  34.32 
 
 		 653 aa  355  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  34.6 
 
 		 679 aa  349  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  34.33 
 
 		 671 aa  343  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  32.66 
 
 		 641 aa  335  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  33.57 
 
 		 641 aa  333  8e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 		 676 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 		 676 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 		 676 aa  327  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  32.28 
 
 		 746 aa  326  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  32.07 
 
 		 619 aa  326  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  32.15 
 
 		 669 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  34.36 
 
 		 660 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  31.81 
 
 		 685 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  31.47 
 
 		 615 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  33.38 
 
 		 636 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  54.23 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  31.12 
 
 		 628 aa  317  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  32.47 
 
 		 665 aa  313  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  31.79 
 
 		 670 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 		 588 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  33.91 
 
 		 690 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  32.86 
 
 		 659 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  30.74 
 
 		 780 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  31.91 
 
 		 631 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  48.61 
 
 		 613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  51.76 
 
 		 607 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  49.82 
 
 		 609 aa  304  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  51.76 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  30.36 
 
 		 628 aa  302  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  52.14 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  51.58 
 
 		 619 aa  301  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  47.18 
 
 		 609 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  29.48 
 
 		 627 aa  299  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>