More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1014 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1014  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 700 aa  1418    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00594805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2175  excinuclease ABC subunit C  58.92 
 
 		 688 aa  776    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  54.09 
 
 		 762 aa  731    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  53.89 
 
 		 687 aa  706    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  54.55 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  52.73 
 
 		 605 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 		 613 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  31.02 
 
 		 652 aa  287  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  31.87 
 
 		 676 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  31.87 
 
 		 676 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  31.87 
 
 		 676 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  45.71 
 
 		 612 aa  280  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  43.77 
 
 		 626 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  27.87 
 
 		 658 aa  268  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.8 
 
 		 625 aa  264  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  28.86 
 
 		 674 aa  263  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 		 624 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  28.49 
 
 		 677 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  28.95 
 
 		 740 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 615 aa  258  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  42.26 
 
 		 641 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  27.14 
 
 		 780 aa  256  9e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  29.38 
 
 		 753 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  42.62 
 
 		 613 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  43.69 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  42.36 
 
 		 677 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  28.5 
 
 		 685 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  42.99 
 
 		 689 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  44.23 
 
 		 716 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  40.45 
 
 		 617 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  42.96 
 
 		 588 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 		 613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  41.14 
 
 		 614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  40.95 
 
 		 653 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  42.41 
 
 		 610 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.07 
 
 		 607 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  43.17 
 
 		 707 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  39.81 
 
 		 591 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  43.13 
 
 		 707 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 		 613 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 610 aa  239  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  43.13 
 
 		 707 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  40.43 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  40.25 
 
 		 649 aa  238  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 610 aa  238  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 610 aa  238  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 610 aa  238  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 610 aa  237  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 610 aa  238  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  40.57 
 
 		 623 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 593 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  40.54 
 
 		 620 aa  236  8e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  40.75 
 
 		 610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.92 
 
 		 607 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  40.82 
 
 		 610 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  40.82 
 
 		 610 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.92 
 
 		 607 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  40.82 
 
 		 610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.69 
 
 		 591 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 620 aa  234  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 620 aa  234  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 610 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 610 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 610 aa  233  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 		 609 aa  233  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 617 aa  233  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 610 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 		 609 aa  233  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 617 aa  233  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  39.17 
 
 		 636 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 610 aa  231  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  39.81 
 
 		 598 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  39.69 
 
 		 610 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 610 aa  231  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  44.26 
 
 		 608 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  40.06 
 
 		 590 aa  230  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  44.26 
 
 		 608 aa  230  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  40.85 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 		 611 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  44.64 
 
 		 607 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 607 aa  229  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  37.92 
 
 		 610 aa  229  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  37.39 
 
 		 635 aa  229  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  39.42 
 
 		 622 aa  228  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 639 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 		 588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  38.01 
 
 		 610 aa  226  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  41.23 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  41.23 
 
 		 623 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  42.9 
 
 		 607 aa  225  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  38.92 
 
 		 609 aa  225  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  38.11 
 
 		 700 aa  224  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.88 
 
 		 607 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  42.44 
 
 		 607 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  39.81 
 
 		 631 aa  223  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  39.94 
 
 		 666 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>