More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1115 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  60.92 
 
 
617 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  53.88 
 
 
644 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  61.16 
 
 
640 aa  832    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  61.22 
 
 
640 aa  831    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  60.19 
 
 
627 aa  793    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1115  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
679 aa  1383    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.86041  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  89.7 
 
 
661 aa  1156    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  60.92 
 
 
617 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  57.94 
 
 
652 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  67.19 
 
 
643 aa  865    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  57.94 
 
 
652 aa  806    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  59.69 
 
 
638 aa  800    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  62.56 
 
 
624 aa  812    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14941  excinuclease ABC subunit C  76.99 
 
 
667 aa  992    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  60.13 
 
 
622 aa  801    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  58.1 
 
 
652 aa  810    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08821  excinuclease ABC subunit C  60.94 
 
 
647 aa  789    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23805  hitchhiker  0.000233595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  58.13 
 
 
625 aa  753    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.03 
 
 
607 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.76 
 
 
685 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  39.07 
 
 
607 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 
604 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 
607 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.72 
 
 
624 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.56 
 
 
601 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.96 
 
 
607 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 
588 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  35.37 
 
 
625 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  38.79 
 
 
614 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  38.02 
 
 
613 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.22 
 
 
615 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  36.27 
 
 
708 aa  392  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.4 
 
 
613 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 
615 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 
598 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 
619 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 
631 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  35.82 
 
 
613 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.64 
 
 
622 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 
620 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 
620 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.85 
 
 
641 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  35.9 
 
 
674 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  36.53 
 
 
671 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  32.97 
 
 
613 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 
635 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  35.59 
 
 
669 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  35.5 
 
 
617 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 
670 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36.1 
 
 
653 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  36.61 
 
 
656 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 
614 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  37.04 
 
 
607 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  37.16 
 
 
611 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  36.45 
 
 
647 aa  369  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.43 
 
 
677 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  36.11 
 
 
675 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  34.59 
 
 
636 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 
631 aa  365  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  32.58 
 
 
644 aa  364  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  36.59 
 
 
649 aa  363  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  35.79 
 
 
643 aa  363  7.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  34.53 
 
 
628 aa  362  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  36.21 
 
 
641 aa  361  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 
629 aa  361  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 
704 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  35.88 
 
 
651 aa  360  4e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.54 
 
 
665 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.22 
 
 
628 aa  360  6e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  35.94 
 
 
644 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  36.6 
 
 
646 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  36.79 
 
 
689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 
612 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  36.27 
 
 
665 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  35.49 
 
 
700 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  35.49 
 
 
613 aa  356  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 
631 aa  356  7.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 
653 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 
669 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  36.21 
 
 
678 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 
660 aa  355  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  34.51 
 
 
627 aa  354  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 
604 aa  354  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 
690 aa  353  5e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 
613 aa  353  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  35.77 
 
 
623 aa  353  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
691 aa  353  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  36.02 
 
 
678 aa  353  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  36.77 
 
 
591 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  35.51 
 
 
599 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 
690 aa  352  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  35.61 
 
 
623 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  34.71 
 
 
649 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 
623 aa  351  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 
610 aa  350  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  35.67 
 
 
707 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  36.06 
 
 
676 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  36.06 
 
 
676 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  36.06 
 
 
676 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 
658 aa  350  6e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>