13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  100 
 
 		 606 aa  1062    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1097  hypothetical protein  32.51 
 
 		 512 aa  100  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3396  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.69 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  51.81 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  46.38 
 
 		 1594 aa  58.9  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.83 
 
 		 1781 aa  57.8  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  37.89 
 
 		 2449 aa  53.9  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6141  secreted trypsin-like serine protease  41.18 
 
 		 94 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  40.22 
 
 		 3409 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0146  surface protein  28.65 
 
 		 266 aa  52  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3471  hypothetical protein  23.83 
 
 		 646 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  75 
 
 		 1407 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9256  hypothetical protein  41.1 
 
 		 380 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>