19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0638 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0714  hypothetical protein  64.31 
 
 		 1387 aa  1744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 1407 aa  2892    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0742  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.54 
 
 		 1355 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  40.31 
 
 		 2074 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  39.83 
 
 		 1908 aa  71.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  32.03 
 
 		 1081 aa  56.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  38.3 
 
 		 1264 aa  55.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  37.29 
 
 		 8918 aa  52.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  43.42 
 
 		 1755 aa  50.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  75 
 
 		 606 aa  50.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  28.27 
 
 		 1831 aa  49.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  51.11 
 
 		 462 aa  48.9  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2082  hypothetical protein  46 
 
 		 1703 aa  48.9  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112234 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  51.43 
 
 		 1594 aa  48.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1487 aa  47.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  31.33 
 
 		 14609 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1987 aa  45.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  31.54 
 
 		 1394 aa  45.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  41.18 
 
 		 561 aa  45.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>