47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4371 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 
561 aa  1118    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  47.67 
 
 
561 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  43.89 
 
 
433 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  35.37 
 
 
499 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  34.38 
 
 
490 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  34.22 
 
 
425 aa  190  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  32.1 
 
 
464 aa  180  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  37.74 
 
 
464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  38.14 
 
 
449 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  33.24 
 
 
526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  37.12 
 
 
473 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  32.33 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  32.29 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  33 
 
 
429 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  32.33 
 
 
930 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  30.65 
 
 
944 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  28.57 
 
 
554 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  32.01 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  29.95 
 
 
946 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  29.18 
 
 
967 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  30.67 
 
 
507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  27.75 
 
 
935 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  34.12 
 
 
525 aa  108  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  26.34 
 
 
529 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  28.3 
 
 
392 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  30.77 
 
 
390 aa  90.1  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  31.98 
 
 
533 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  38.38 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2967  hypothetical protein  41.51 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  23.77 
 
 
564 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  39.77 
 
 
1081 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  44.09 
 
 
386 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  32.48 
 
 
379 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.7 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  32.03 
 
 
442 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  27.04 
 
 
415 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  38.16 
 
 
720 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  25.81 
 
 
453 aa  47  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  29.36 
 
 
833 aa  47  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.33 
 
 
934 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.18 
 
 
1407 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  30.28 
 
 
473 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  37.33 
 
 
1486 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1377  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35.94 
 
 
535 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  27.88 
 
 
428 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  32.5 
 
 
1527 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.5 
 
 
853 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>