25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2911 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  100 
 
 		 833 aa  1675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  76.87 
 
 		 832 aa  1296    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  57.67 
 
 		 853 aa  959    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  29.95 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  31.23 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  29.89 
 
 		 454 aa  134  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  29.51 
 
 		 379 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  29.23 
 
 		 386 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  38.33 
 
 		 669 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  36.67 
 
 		 667 aa  120  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.36 
 
 		 326 aa  115  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  29.61 
 
 		 473 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 428 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.97 
 
 		 884 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0733  hypothetical protein  26.91 
 
 		 531 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.34 
 
 		 934 aa  50.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.36 
 
 		 561 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.36 
 
 		 416 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.36 
 
 		 416 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.36 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.36 
 
 		 416 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  45.33 
 
 		 554 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  26.36 
 
 		 400 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1486 aa  45.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0548  hypothetical protein  30 
 
 		 400 aa  44.3  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>