37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4229 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  50.11 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  46.25 
 
 		 499 aa  316  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  43.89 
 
 		 561 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  39.27 
 
 		 464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  37.01 
 
 		 490 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  46.18 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  44.71 
 
 		 425 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  35.84 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  41.64 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  34.24 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  38.06 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  35.9 
 
 		 967 aa  192  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  36.82 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  41.28 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  40 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  39.12 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  38.06 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  33.25 
 
 		 944 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 930 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  31.56 
 
 		 946 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  29.96 
 
 		 529 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  33.9 
 
 		 935 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  35.79 
 
 		 390 aa  136  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  32.9 
 
 		 507 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  30.22 
 
 		 533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  39.15 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.27 
 
 		 564 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  35.56 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4720  hypothetical protein  32.26 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  33.09 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.46 
 
 		 934 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2012  Parallel beta-helix repeat protein  38.16 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1486 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  30.21 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  20.96 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>