37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3256 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1083    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  44.01 
 
 
446 aa  313  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  41.91 
 
 
473 aa  243  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  41.64 
 
 
433 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  31.83 
 
 
967 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  41.2 
 
 
499 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  38.21 
 
 
935 aa  194  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  30.17 
 
 
554 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  36.13 
 
 
946 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  32.79 
 
 
930 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  41.74 
 
 
449 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  30.98 
 
 
944 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  29.52 
 
 
490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  36.65 
 
 
464 aa  160  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  38.31 
 
 
464 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  41.5 
 
 
561 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3914  hypothetical protein  63.03 
 
 
179 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.24 
 
 
561 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  32.9 
 
 
507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  33.55 
 
 
392 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  30.96 
 
 
525 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  34.64 
 
 
390 aa  144  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  30.65 
 
 
425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  29.03 
 
 
529 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  34.21 
 
 
432 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  33.2 
 
 
533 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  36.45 
 
 
429 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  38.95 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
564 aa  97.8  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.05 
 
 
934 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3705  hypothetical protein  30.7 
 
 
442 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  37.78 
 
 
386 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  36.67 
 
 
379 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6375  hypothetical protein  22.99 
 
 
475 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  32.29 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  34.41 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.65 
 
 
326 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>