27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1299 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  100 
 
 		 445 aa  888    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  50.11 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  46.58 
 
 		 415 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  44.38 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  44.38 
 
 		 379 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  36.46 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  36.83 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  29.95 
 
 		 833 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.94 
 
 		 832 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.08 
 
 		 853 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  33.71 
 
 		 667 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.33 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  32.02 
 
 		 669 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  32.8 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  31.73 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  30.68 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.17 
 
 		 561 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.29 
 
 		 934 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  32.29 
 
 		 526 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  25.71 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  30.64 
 
 		 967 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  20.73 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  34.04 
 
 		 930 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  32.43 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.87 
 
 		 884 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>