28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0636 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  100 
 
 		 946 aa  1924    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  81.68 
 
 		 944 aa  1592    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  38.81 
 
 		 967 aa  582  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  40.61 
 
 		 930 aa  582  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  36.48 
 
 		 935 aa  482  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  32.09 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  35.42 
 
 		 446 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  36.13 
 
 		 526 aa  180  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  34.66 
 
 		 507 aa  175  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  41.03 
 
 		 392 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  36.19 
 
 		 473 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  31.81 
 
 		 529 aa  163  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  37.42 
 
 		 390 aa  161  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  32.22 
 
 		 525 aa  159  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 564 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  30.77 
 
 		 554 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  35.93 
 
 		 464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  31.52 
 
 		 490 aa  148  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  33.99 
 
 		 425 aa  147  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  36.2 
 
 		 499 aa  144  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.17 
 
 		 561 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  34.07 
 
 		 433 aa  141  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  36.65 
 
 		 449 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  31.46 
 
 		 464 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  34.04 
 
 		 429 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  31.58 
 
 		 432 aa  125  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.6 
 
 		 561 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  27.88 
 
 		 430 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>