32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2257 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  848    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  46.58 
 
 
445 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  49.1 
 
 
379 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  41.91 
 
 
454 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  47.89 
 
 
386 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  38.87 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  36.53 
 
 
473 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  31.23 
 
 
833 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.53 
 
 
832 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.9 
 
 
853 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  27 
 
 
667 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.94 
 
 
326 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  24.8 
 
 
669 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  32.69 
 
 
499 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0548  hypothetical protein  29.05 
 
 
400 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.11 
 
 
934 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  31.18 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  33.98 
 
 
1486 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  33.94 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  29.89 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  25.48 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.33 
 
 
561 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.04 
 
 
561 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  32.95 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  29.51 
 
 
554 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  30.21 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3705  hypothetical protein  27.73 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  34.41 
 
 
526 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  32.99 
 
 
473 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  32.95 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  32.67 
 
 
432 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>