41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5438 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 561 aa  1118    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  47.91 
 
 		 561 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  50.11 
 
 		 433 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  43.76 
 
 		 499 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  38.72 
 
 		 490 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  37.14 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  37.22 
 
 		 464 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  35.91 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  35.54 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  40.22 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  33.18 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  32.89 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  34.67 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  33.17 
 
 		 944 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  36.94 
 
 		 432 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  31.23 
 
 		 946 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  34.22 
 
 		 930 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  28.86 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  32 
 
 		 967 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  27.92 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  29.26 
 
 		 935 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  31.19 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  35.31 
 
 		 390 aa  141  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  30.98 
 
 		 507 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  31.68 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  29.53 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  26.23 
 
 		 533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  42.42 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  35.34 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  44.94 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  43.96 
 
 		 1081 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 415 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0714  hypothetical protein  45 
 
 		 1387 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2967  hypothetical protein  34.48 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  26.01 
 
 		 454 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1377  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  41.54 
 
 		 535 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  40 
 
 		 720 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.46 
 
 		 1407 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>