26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2496 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  100 
 
 		 428 aa  858    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  38.87 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  42.23 
 
 		 473 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  37.31 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  34.47 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  38.59 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  37.58 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  26.09 
 
 		 833 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.47 
 
 		 832 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.56 
 
 		 853 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  24.93 
 
 		 669 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  30.46 
 
 		 667 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  21.93 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.63 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2363  hypothetical protein  26.33 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  28.57 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  29.01 
 
 		 499 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  29.84 
 
 		 490 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  31.4 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  34.21 
 
 		 449 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3116  hypothetical protein  23.55 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0200817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.59 
 
 		 561 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  25.64 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3705  hypothetical protein  26.28 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  26.92 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  27.89 
 
 		 464 aa  43.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>