35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1203 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  88.6 
 
 		 379 aa  679    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  786    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  47.89 
 
 		 415 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  42.82 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  38.84 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  36.39 
 
 		 473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  37.58 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  29.48 
 
 		 833 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.91 
 
 		 832 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.22 
 
 		 853 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  28.78 
 
 		 667 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  29.91 
 
 		 669 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.9 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  43.01 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  42.42 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  39.24 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  35.71 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  37.65 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.28 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  39.47 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  41.57 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  31.29 
 
 		 526 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  44.09 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  40.26 
 
 		 425 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1486 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  27.73 
 
 		 967 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  32.46 
 
 		 554 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  32.69 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  34.78 
 
 		 464 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  30.16 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 946 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  37.68 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  39.36 
 
 		 930 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>