15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0575 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  57.08 
 
 
667 aa  754    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  100 
 
 
669 aa  1372    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.55 
 
 
326 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  38.33 
 
 
833 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.42 
 
 
832 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.16 
 
 
853 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  34.08 
 
 
379 aa  94.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  31.28 
 
 
386 aa  88.6  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  32.02 
 
 
445 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  24.8 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  25.23 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  29.85 
 
 
454 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  30.77 
 
 
473 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0590  hypothetical protein  31.69 
 
 
249 aa  61.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2468  hypothetical protein  28.86 
 
 
267 aa  54.7  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>