37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0175 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  988    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  44.91 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  38.72 
 
 		 561 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  46.31 
 
 		 499 aa  243  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  40.66 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.38 
 
 		 561 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  41.69 
 
 		 464 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  38.69 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  32.24 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  39.56 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  37.9 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  31 
 
 		 967 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  29.52 
 
 		 526 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  35.65 
 
 		 473 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  34.94 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  36.33 
 
 		 930 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  32.47 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  30.04 
 
 		 944 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  40.32 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 946 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 935 aa  146  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  35.51 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  32.07 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  29.41 
 
 		 507 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  30.84 
 
 		 525 aa  133  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  27.65 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  38.6 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 		 564 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  37.61 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  39.81 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4720  hypothetical protein  30.88 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  25.48 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1486 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  23.46 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.17 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>