16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3705 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3705  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  902    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10793  hypothetical protein  27.38 
 
 
515 aa  157  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0236  hypothetical protein  34.21 
 
 
506 aa  156  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4720  hypothetical protein  26.95 
 
 
503 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  29.88 
 
 
446 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  30.7 
 
 
526 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6375  hypothetical protein  30 
 
 
475 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.05 
 
 
884 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  32.98 
 
 
554 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  27.73 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  28.69 
 
 
944 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  31.03 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.42 
 
 
934 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.69 
 
 
832 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2399  hypothetical protein  32.22 
 
 
433 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  30.34 
 
 
433 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>