14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3116 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2363  hypothetical protein  74.29 
 
 		 522 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  998    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0200817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0733  hypothetical protein  53.41 
 
 		 531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2832  hypothetical protein  40.67 
 
 		 527 aa  302  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1649  hypothetical protein  47.54 
 
 		 522 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0418  hypothetical protein  32.91 
 
 		 550 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000875198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32 
 
 		 884 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1486 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  27.92 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.41 
 
 		 934 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  24.22 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  27.44 
 
 		 454 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.12 
 
 		 832 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  23.48 
 
 		 415 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>