25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0363 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 934 aa  1877    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2012  Parallel beta-helix repeat protein  28 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  30.12 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  30.28 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  26.68 
 
 		 833 aa  57.4  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  26.05 
 
 		 526 aa  56.6  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  22.65 
 
 		 415 aa  54.7  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  26.77 
 
 		 499 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1486 aa  54.3  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  41.76 
 
 		 473 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.32 
 
 		 832 aa  52.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2363  hypothetical protein  36.56 
 
 		 522 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  24.46 
 
 		 433 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  24.29 
 
 		 445 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3116  hypothetical protein  34.41 
 
 		 514 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0200817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.99 
 
 		 853 aa  47.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  26.33 
 
 		 561 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.41 
 
 		 884 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  27.84 
 
 		 867 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  22.49 
 
 		 473 aa  45.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1649  hypothetical protein  32.97 
 
 		 522 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0733  hypothetical protein  29.13 
 
 		 531 aa  45.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  26.92 
 
 		 488 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2832  hypothetical protein  32.97 
 
 		 527 aa  44.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>