12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2363 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2363  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1011    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3116  hypothetical protein  76.38 
 
 		 514 aa  676    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0200817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0733  hypothetical protein  53.09 
 
 		 531 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2832  hypothetical protein  40.45 
 
 		 527 aa  306  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1649  hypothetical protein  50.72 
 
 		 522 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0418  hypothetical protein  30.38 
 
 		 550 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000875198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.85 
 
 		 2449 aa  57  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  34 
 
 		 884 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.56 
 
 		 934 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.03 
 
 		 832 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1486 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>