20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5512 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  100 
 
 		 1486 aa  2932    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  37.36 
 
 		 499 aa  54.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.66 
 
 		 934 aa  54.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  41.45 
 
 		 974 aa  53.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  33.98 
 
 		 415 aa  52.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  27 
 
 		 386 aa  52.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  38.37 
 
 		 379 aa  51.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  38.37 
 
 		 464 aa  51.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.92 
 
 		 884 aa  50.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  34.88 
 
 		 429 aa  51.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3116  hypothetical protein  32.41 
 
 		 514 aa  48.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0200817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  37.65 
 
 		 433 aa  48.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  44 
 
 		 316 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  40.66 
 
 		 490 aa  47.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2832  hypothetical protein  31.78 
 
 		 527 aa  46.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0733  hypothetical protein  30.34 
 
 		 531 aa  47  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  36.05 
 
 		 430 aa  46.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  41.33 
 
 		 930 aa  45.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1649  hypothetical protein  38.18 
 
 		 522 aa  45.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  28.46 
 
 		 833 aa  45.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>