25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2317 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  100 
 
 		 473 aa  952    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  38.33 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  34.68 
 
 		 415 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  35.69 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  34.53 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  38.51 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  36.39 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  28.41 
 
 		 833 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.34 
 
 		 832 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.76 
 
 		 853 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  26.42 
 
 		 667 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.66 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  31.35 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  28.69 
 
 		 499 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  29.73 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  29.73 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3116  hypothetical protein  23.65 
 
 		 514 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0200817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  34.83 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.83 
 
 		 934 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  30.91 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  30.68 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  29.67 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  30.19 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.28 
 
 		 561 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  26.81 
 
 		 490 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>