91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2561 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1116    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  34.47 
 
 		 446 aa  206  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  35.97 
 
 		 499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  30.75 
 
 		 526 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 930 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  39.56 
 
 		 490 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  31.59 
 
 		 967 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  39.12 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.33 
 
 		 561 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  40.08 
 
 		 449 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  31.45 
 
 		 935 aa  154  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  30.62 
 
 		 946 aa  153  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  30.05 
 
 		 529 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  35.12 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 944 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  40.89 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  35.43 
 
 		 392 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.21 
 
 		 561 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 		 564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  34.07 
 
 		 390 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  38.31 
 
 		 432 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  38.16 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  29.61 
 
 		 525 aa  123  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  30.49 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  37.44 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  31.25 
 
 		 533 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  51.82 
 
 		 479 aa  97.1  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  48.91 
 
 		 516 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  50 
 
 		 679 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  47.31 
 
 		 990 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  50 
 
 		 931 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  43.64 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  45.16 
 
 		 1270 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  48.86 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  45.65 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  40.78 
 
 		 668 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  44.71 
 
 		 763 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  48 
 
 		 844 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  41.18 
 
 		 520 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  33.14 
 
 		 966 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  43.18 
 
 		 851 aa  70.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  41.94 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  44.16 
 
 		 908 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  45.78 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  41.51 
 
 		 578 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  41.77 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  48.1 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  35.86 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1162 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  34.82 
 
 		 997 aa  65.1  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  52.05 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  40.85 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  35.92 
 
 		 538 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  41.58 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  45.95 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  43.48 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  41.24 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  32.99 
 
 		 902 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  43.42 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  44.71 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  45.45 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  35.71 
 
 		 1061 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  32.52 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  43.75 
 
 		 748 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  41.38 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  40.43 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  32.93 
 
 		 524 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  36.11 
 
 		 741 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  38.04 
 
 		 685 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  36.92 
 
 		 581 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  41.43 
 
 		 1302 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  32.46 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.56 
 
 		 1092 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  36.96 
 
 		 689 aa  51.2  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  38.78 
 
 		 430 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 445 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  29.51 
 
 		 415 aa  47  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1106 aa  47  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  45.33 
 
 		 833 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  37.5 
 
 		 829 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3705  hypothetical protein  32.98 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  35.71 
 
 		 676 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  33.7 
 
 		 870 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.09 
 
 		 934 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  30.68 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1215 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6375  hypothetical protein  23.15 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1486 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  36.36 
 
 		 527 aa  43.9  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>