59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1150 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 1162 aa  2378    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  52.91 
 
 		 896 aa  820    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  46.88 
 
 		 152 aa  87  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  45.45 
 
 		 679 aa  82  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  40.45 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  44.94 
 
 		 287 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  41.74 
 
 		 763 aa  79.3  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  41.67 
 
 		 844 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  42.86 
 
 		 668 aa  76.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  44.79 
 
 		 997 aa  75.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  38.95 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 		 990 aa  73.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  43.62 
 
 		 468 aa  70.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  39.78 
 
 		 479 aa  67.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  41.11 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  37.5 
 
 		 554 aa  66.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  40.45 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  40.45 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  31.65 
 
 		 1061 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  40.51 
 
 		 695 aa  64.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  40.51 
 
 		 545 aa  63.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  39.74 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  36.84 
 
 		 902 aa  62.4  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1270 aa  62  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  41 
 
 		 741 aa  62  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  28.83 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  31.48 
 
 		 851 aa  58.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  29.77 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  37.23 
 
 		 689 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  36.9 
 
 		 468 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  38.1 
 
 		 2324 aa  56.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  36.17 
 
 		 685 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  34.78 
 
 		 595 aa  55.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  55.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  31.65 
 
 		 524 aa  55.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  33.64 
 
 		 525 aa  54.7  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  39.71 
 
 		 931 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  36.25 
 
 		 966 aa  54.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  39.47 
 
 		 615 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3047  hypothetical protein  29.09 
 
 		 325 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40.58 
 
 		 492 aa  53.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  52 
 
 		 562 aa  53.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.35 
 
 		 1092 aa  52.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  32 
 
 		 178 aa  52  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1106 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  36.36 
 
 		 908 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  25.3 
 
 		 565 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  36.78 
 
 		 527 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  30.26 
 
 		 750 aa  48.5  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1073  hypothetical protein  28.4 
 
 		 568 aa  48.5  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  33.33 
 
 		 581 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  33.33 
 
 		 998 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  39.71 
 
 		 542 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  29.76 
 
 		 513 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  32.89 
 
 		 748 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.98 
 
 		 1143 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.33 
 
 		 673 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  37.78 
 
 		 829 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1010 aa  45.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>