59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1003 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  296  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  44.33 
 
 		 851 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  46.67 
 
 		 516 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  46.94 
 
 		 287 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  38.41 
 
 		 668 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  46.67 
 
 		 1162 aa  87  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  48.48 
 
 		 741 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1270 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  41.57 
 
 		 520 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  41 
 
 		 997 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  42.86 
 
 		 479 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  41.3 
 
 		 679 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  38.95 
 
 		 990 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  47.62 
 
 		 763 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  43.04 
 
 		 545 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  42.86 
 
 		 695 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  38.14 
 
 		 468 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  43.82 
 
 		 475 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  41.11 
 
 		 578 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  42.86 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  38.96 
 
 		 844 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  47.22 
 
 		 615 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  39.33 
 
 		 489 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  32.04 
 
 		 468 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  41.33 
 
 		 1061 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  40.24 
 
 		 931 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  41.24 
 
 		 554 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  45.95 
 
 		 595 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  40.62 
 
 		 896 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 525 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  38.96 
 
 		 908 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  39.24 
 
 		 797 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  32.91 
 
 		 398 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  31.63 
 
 		 748 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  41.54 
 
 		 2324 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  31.58 
 
 		 902 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  37.76 
 
 		 966 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  41.46 
 
 		 513 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  36.59 
 
 		 1302 aa  55.1  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  31.13 
 
 		 430 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  34.88 
 
 		 676 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  41.54 
 
 		 562 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.49 
 
 		 1092 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  26.51 
 
 		 524 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  29.23 
 
 		 829 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1406 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60344  mitochondrial succinate-fumarate transporter  40.98 
 
 		 321 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0581106  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.43 
 
 		 492 aa  44.3  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1106 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5215  hypothetical protein  31.25 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  24.03 
 
 		 674 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08391  hypothetical protein  28.92 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  28.21 
 
 		 998 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0352  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.371512  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  29.03 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  31.25 
 
 		 365 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  29.31 
 
 		 581 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1010 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>