119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2009 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  100 
 
 		 748 aa  1540    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  59.49 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  62.38 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  59.48 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  62.06 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  54.63 
 
 		 347 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  50.64 
 
 		 709 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  34.01 
 
 		 505 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  34.48 
 
 		 505 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  37.23 
 
 		 755 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  35.91 
 
 		 930 aa  205  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  32.62 
 
 		 346 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  32.72 
 
 		 322 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  32.52 
 
 		 1302 aa  165  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  34.55 
 
 		 630 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  32.11 
 
 		 638 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  33.44 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  52.31 
 
 		 768 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  30.75 
 
 		 610 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  34.45 
 
 		 426 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1167 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  51.64 
 
 		 912 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  48.09 
 
 		 818 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  29.87 
 
 		 457 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  50.42 
 
 		 873 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  44.96 
 
 		 674 aa  104  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.9 
 
 		 1246 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.52 
 
 		 524 aa  97.8  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  36.67 
 
 		 159 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.67 
 
 		 159 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  36 
 
 		 159 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  41.46 
 
 		 552 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  26.76 
 
 		 717 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  31.9 
 
 		 1131 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  24 
 
 		 626 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  25.83 
 
 		 1194 aa  79.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  23.59 
 
 		 358 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  33.14 
 
 		 506 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  30.22 
 
 		 1657 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  23.77 
 
 		 703 aa  73.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  22.73 
 
 		 651 aa  69.7  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  23.53 
 
 		 1221 aa  69.7  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  21.74 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  35.37 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  39.08 
 
 		 479 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  30.72 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  41.03 
 
 		 287 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  20.85 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  21.59 
 
 		 1004 aa  57.8  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  19.93 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  31.63 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 990 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  32.22 
 
 		 545 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  43.08 
 
 		 554 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  35.53 
 
 		 520 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  33.77 
 
 		 689 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  37.97 
 
 		 468 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  33.77 
 
 		 685 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  36.07 
 
 		 581 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  29.13 
 
 		 997 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  21.76 
 
 		 1061 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.33 
 
 		 1362 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  32.05 
 
 		 513 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.54 
 
 		 477 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.49 
 
 		 584 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  35.44 
 
 		 931 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  38.96 
 
 		 1418 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  32 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  35.9 
 
 		 595 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0883  hypothetical protein  29.76 
 
 		 153 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  32.05 
 
 		 750 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  20.65 
 
 		 566 aa  51.2  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  20.21 
 
 		 558 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.6 
 
 		 312 aa  50.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  21.9 
 
 		 481 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  30.77 
 
 		 679 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  33.77 
 
 		 258 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  31.58 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  31.4 
 
 		 615 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.06 
 
 		 900 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.03 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  36.96 
 
 		 1302 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.97 
 
 		 644 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  32.29 
 
 		 578 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  32.26 
 
 		 797 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  38.03 
 
 		 966 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  31.88 
 
 		 998 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  32.63 
 
 		 468 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  34.52 
 
 		 741 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  31.9 
 
 		 373 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 468 aa  48.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.93 
 
 		 1158 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.25 
 
 		 492 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  30.91 
 
 		 763 aa  47.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  26.44 
 
 		 178 aa  47.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  27.5 
 
 		 1471 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1162 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>