89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2390 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  984    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  39.95 
 
 		 426 aa  247  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  38.56 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  38.7 
 
 		 733 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  37 
 
 		 458 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  38.48 
 
 		 437 aa  226  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  38.02 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  35.78 
 
 		 750 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  35.94 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  39.43 
 
 		 653 aa  207  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  38.15 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  36.52 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  43.18 
 
 		 576 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  39.49 
 
 		 338 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  41.94 
 
 		 540 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  35.33 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  32.38 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  38.52 
 
 		 922 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  38.06 
 
 		 616 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.51 
 
 		 694 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  35.17 
 
 		 1409 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  35.35 
 
 		 1431 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  34.84 
 
 		 907 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  33.73 
 
 		 744 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  33.03 
 
 		 744 aa  123  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  32.09 
 
 		 734 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  32.99 
 
 		 734 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  30.99 
 
 		 700 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  32.06 
 
 		 742 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.97 
 
 		 428 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  39.53 
 
 		 763 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  43.64 
 
 		 990 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00565  pectate lyase L  38.96 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  33.1 
 
 		 851 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  45.45 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  52.63 
 
 		 931 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  40.7 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  44.09 
 
 		 595 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  41.24 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  40.52 
 
 		 844 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  35.34 
 
 		 966 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  26.88 
 
 		 480 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1162 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  39.33 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  50 
 
 		 1270 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  41.18 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  30.95 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  43.42 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  27.49 
 
 		 665 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  38 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  41.57 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  35.96 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  45.45 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  40.91 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  36.9 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  39.53 
 
 		 615 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  31.03 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  34.91 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  37.5 
 
 		 679 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  41.46 
 
 		 578 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  30.84 
 
 		 902 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  38.46 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.79 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.02 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  28.71 
 
 		 870 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  32.67 
 
 		 502 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  33.98 
 
 		 741 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.65 
 
 		 965 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  37.23 
 
 		 294 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  40.96 
 
 		 997 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  35 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.63 
 
 		 673 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  38.89 
 
 		 908 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  33.6 
 
 		 398 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  32.53 
 
 		 178 aa  47  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  45.45 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.21 
 
 		 1092 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  33.03 
 
 		 951 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  31.15 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.63 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3563  hypothetical protein  47.06 
 
 		 82 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  38.36 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  40.3 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  42.86 
 
 		 896 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1024 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  31.76 
 
 		 676 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  27.07 
 
 		 677 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>