33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1888 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1246    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  51.35 
 
 		 1409 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  48.54 
 
 		 653 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  47.28 
 
 		 750 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  50 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  52.85 
 
 		 922 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  46.63 
 
 		 576 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  38.59 
 
 		 1431 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  42.94 
 
 		 338 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  33.33 
 
 		 744 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  32.26 
 
 		 744 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  34 
 
 		 742 aa  171  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  32.99 
 
 		 907 aa  171  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  30.1 
 
 		 734 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  29.35 
 
 		 734 aa  161  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  36.56 
 
 		 733 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  34.48 
 
 		 700 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  38.06 
 
 		 489 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  35.24 
 
 		 410 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  30.63 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  32.25 
 
 		 425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  30.3 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  29.32 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  30.33 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  27.67 
 
 		 437 aa  101  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  27.85 
 
 		 437 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  30.5 
 
 		 439 aa  97.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  28.37 
 
 		 458 aa  93.6  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  27.29 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 		 694 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  32.43 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  33.04 
 
 		 480 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  33.04 
 
 		 341 aa  44.3  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>