31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  100 
 
 		 907 aa  1816    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  32.02 
 
 		 1431 aa  361  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  40.69 
 
 		 653 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  28.48 
 
 		 700 aa  212  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  42.32 
 
 		 540 aa  210  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  28.77 
 
 		 742 aa  207  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  39.25 
 
 		 750 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  27.64 
 
 		 734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  26.93 
 
 		 734 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  40.96 
 
 		 576 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  27.6 
 
 		 744 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  26.32 
 
 		 744 aa  188  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  29.88 
 
 		 1409 aa  178  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  35.31 
 
 		 922 aa  173  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  32.99 
 
 		 616 aa  170  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  33.5 
 
 		 547 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  37.14 
 
 		 425 aa  138  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  33.68 
 
 		 426 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  35.23 
 
 		 733 aa  131  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  34.84 
 
 		 489 aa  131  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  34.68 
 
 		 415 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  32.83 
 
 		 410 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  31.65 
 
 		 437 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  30.57 
 
 		 437 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  28.61 
 
 		 439 aa  108  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  30.58 
 
 		 338 aa  100  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  32.57 
 
 		 458 aa  99  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  31.34 
 
 		 439 aa  97.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.58 
 
 		 694 aa  96.3  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  26.3 
 
 		 491 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  30.04 
 
 		 520 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>