30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4134 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  63.28 
 
 		 744 aa  895    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  100 
 
 		 700 aa  1439    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  63.28 
 
 		 744 aa  895    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  62.87 
 
 		 734 aa  874    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  62.46 
 
 		 734 aa  901    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  47.13 
 
 		 742 aa  618  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  28.48 
 
 		 907 aa  207  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  32.27 
 
 		 1431 aa  197  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  34.46 
 
 		 750 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  39.22 
 
 		 1409 aa  171  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  35.22 
 
 		 540 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  35.44 
 
 		 576 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  34.97 
 
 		 616 aa  154  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  35.44 
 
 		 653 aa  153  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  36.58 
 
 		 922 aa  140  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  34.59 
 
 		 733 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  32.84 
 
 		 425 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  32.35 
 
 		 426 aa  114  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  30.72 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  30.8 
 
 		 338 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  30.99 
 
 		 489 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  30.82 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  31.51 
 
 		 415 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  28.19 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  30.39 
 
 		 439 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  28.05 
 
 		 437 aa  70.1  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.67 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  25.36 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  25.62 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  28.14 
 
 		 491 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>