34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1528 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 425 aa  861    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  80.05 
 
 		 426 aa  675    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  65.5 
 
 		 733 aa  529  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  38.56 
 
 		 489 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  40.91 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  39.57 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  37.82 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  33.93 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  38.4 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  37.53 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  38.36 
 
 		 338 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  35.54 
 
 		 750 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  34.42 
 
 		 653 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  34.5 
 
 		 540 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  38.1 
 
 		 1431 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  31.79 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  37.25 
 
 		 907 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  31.67 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  34.25 
 
 		 1409 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  32.72 
 
 		 616 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  32.49 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  33.12 
 
 		 744 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  33.33 
 
 		 734 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  32.5 
 
 		 744 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  32.07 
 
 		 576 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  31.27 
 
 		 734 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.69 
 
 		 694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  32.42 
 
 		 700 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  33.66 
 
 		 742 aa  120  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  32.38 
 
 		 922 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00565  pectate lyase L  34.83 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  25.41 
 
 		 665 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  29.37 
 
 		 652 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0160  hypothetical protein  46.67 
 
 		 600 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>