29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1169 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 870 aa  1772    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  33.82 
 
 		 990 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  41.11 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  23.28 
 
 		 672 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  23.28 
 
 		 672 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  23.28 
 
 		 672 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  28.71 
 
 		 489 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  43.75 
 
 		 668 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  38.95 
 
 		 763 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  36.59 
 
 		 562 aa  51.6  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  23.3 
 
 		 896 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  32.7 
 
 		 581 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  23.3 
 
 		 908 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  23.3 
 
 		 896 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  34.88 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  24.3 
 
 		 968 aa  49.7  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1270 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  33.71 
 
 		 578 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  36.59 
 
 		 520 aa  47.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  40.51 
 
 		 997 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  29.6 
 
 		 2334 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  37.84 
 
 		 931 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.53 
 
 		 1092 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  26.18 
 
 		 1260 aa  45.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  33.7 
 
 		 554 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  33.11 
 
 		 525 aa  44.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  24.5 
 
 		 629 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  41.18 
 
 		 695 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  31.71 
 
 		 908 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>