34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0412 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 468 aa  910    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.24 
 
 		 1412 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  30.88 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 759 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.79 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  28.29 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  26.9 
 
 		 563 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2354  hypothetical protein  24.94 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  50.98 
 
 		 1024 aa  57  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1066 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.32 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  29.05 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.17 
 
 		 905 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  26.81 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  23.9 
 
 		 570 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  34.31 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  39.13 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  40 
 
 		 653 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  35.19 
 
 		 341 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  22.78 
 
 		 302 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  37.5 
 
 		 480 aa  47.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  24.32 
 
 		 665 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1881  hypothetical protein  35.34 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000514477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7283  hypothetical protein  28.04 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.71 
 
 		 694 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  31.15 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.06 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  24.75 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  35.91 
 
 		 848 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  36.54 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3406  hypothetical protein  28.09 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.87 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.72 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  25.59 
 
 		 735 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>