22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0468 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  100 
 
 		 653 aa  1324    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  48.84 
 
 		 638 aa  635    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  46.89 
 
 		 644 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1881  hypothetical protein  47.76 
 
 		 571 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000514477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  45.57 
 
 		 520 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  43.59 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1024 aa  58.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.14 
 
 		 500 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  33.04 
 
 		 839 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  32.76 
 
 		 368 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.31 
 
 		 965 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  40 
 
 		 468 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.04 
 
 		 512 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  33.78 
 
 		 665 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  31.62 
 
 		 446 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.56 
 
 		 694 aa  47.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  34.18 
 
 		 547 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  40.79 
 
 		 1011 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  38.27 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.71 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4459  hypothetical protein  30.28 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1121 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>