79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2850 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  100 
 
 		 665 aa  1360    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  32.75 
 
 		 814 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  30.85 
 
 		 373 aa  91.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.42 
 
 		 512 aa  90.9  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  26.25 
 
 		 520 aa  90.9  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  33.88 
 
 		 975 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  28.9 
 
 		 495 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  26.09 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  25.85 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  29.41 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  27.95 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  39.8 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.4 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1066 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  31.15 
 
 		 642 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  26.54 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  28 
 
 		 1405 aa  65.1  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  28.95 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.81 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.77 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  27.04 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  28.41 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  25.11 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.79 
 
 		 1392 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  27.49 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  26.01 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  29.84 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  26.97 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.3 
 
 		 2031 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  22.09 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.1 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  24.54 
 
 		 677 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  22.97 
 
 		 563 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  40.23 
 
 		 3066 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2753  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1597 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  26.86 
 
 		 653 aa  54.3  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  30.43 
 
 		 759 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  46.43 
 
 		 446 aa  53.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1024 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  24.33 
 
 		 426 aa  52.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  44.07 
 
 		 1755 aa  51.6  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  26.36 
 
 		 338 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1515  hypothetical protein  33.91 
 
 		 586 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000161589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  26.67 
 
 		 669 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  27.04 
 
 		 439 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  26.4 
 
 		 633 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1413 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  25.71 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  32.65 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  25.41 
 
 		 425 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  33.64 
 
 		 723 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  33.78 
 
 		 653 aa  47.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  29.71 
 
 		 472 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  24.32 
 
 		 468 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  30.89 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1106 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2350  hypothetical protein  21.9 
 
 		 473 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  31.91 
 
 		 932 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  25.62 
 
 		 1431 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28530  hypothetical protein  29.13 
 
 		 364 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0528408  normal  0.0603049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  37.31 
 
 		 1526 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  27.27 
 
 		 641 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  30.77 
 
 		 644 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1121 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  25.17 
 
 		 922 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  27.93 
 
 		 649 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0255  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  28.4 
 
 		 740 aa  44.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.651298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 		 491 aa  44.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  31.51 
 
 		 638 aa  44.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  27.43 
 
 		 647 aa  44.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  28.32 
 
 		 502 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  22.58 
 
 		 768 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  30.39 
 
 		 774 aa  44.3  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  39.71 
 
 		 1332 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  24.22 
 
 		 750 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1201 aa  43.9  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  25.52 
 
 		 535 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.37 
 
 		 496 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.38 
 
 		 463 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>