48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0662 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 500 aa  1000    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  49.2 
 
 		 502 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.9 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  39.96 
 
 		 520 aa  346  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  39.47 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  34.76 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  31.95 
 
 		 505 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1929  hypothetical protein  25 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  27.06 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  27.84 
 
 		 677 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  26.81 
 
 		 759 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  27.34 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  30.94 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  28.81 
 
 		 665 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.35 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  28.82 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  29.02 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  30.09 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.37 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  51.56 
 
 		 1526 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  25.44 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1066 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  35.58 
 
 		 965 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.48 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  29.14 
 
 		 653 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1024 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  35.79 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  23 
 
 		 694 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  30.22 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2350  hypothetical protein  27.75 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1945  hypothetical protein  23.14 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  30.51 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0151  ATP-dependent DNA helicase RepA  26.46 
 
 		 494 aa  50.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.211461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  30.26 
 
 		 341 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  40.3 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  37.5 
 
 		 852 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  38.89 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  32.47 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  23.92 
 
 		 2972 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  41.82 
 
 		 1296 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  40 
 
 		 1332 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4459  hypothetical protein  39.13 
 
 		 778 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  26.87 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  31.21 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  35.14 
 
 		 638 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  36 
 
 		 540 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  42.86 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>