15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4459 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4459  hypothetical protein  100 
 
 		 778 aa  1553    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  27.65 
 
 		 975 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  37.43 
 
 		 1565 aa  85.1  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5589  hypothetical protein  24.2 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3797  hypothetical protein  27.49 
 
 		 471 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0160  hypothetical protein  22.16 
 
 		 600 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3947  hypothetical protein  25.15 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.917121  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  34.81 
 
 		 890 aa  64.7  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  32.35 
 
 		 2066 aa  63.9  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  30.06 
 
 		 1150 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  33.99 
 
 		 623 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1916 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1668  hypothetical protein  28.79 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  30.28 
 
 		 653 aa  45.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.13 
 
 		 500 aa  44.3  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>