43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3111 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  896    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  77.34 
 
 		 368 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  35.9 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  35.59 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.83 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  36.54 
 
 		 677 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  31.7 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.35 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.4 
 
 		 2031 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 		 759 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.81 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  26.42 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  37.11 
 
 		 3066 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.36 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.68 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  24.07 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  43.06 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  46.67 
 
 		 1755 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1066 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  46.43 
 
 		 665 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1106 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  31.11 
 
 		 338 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1117 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1117 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  25.24 
 
 		 624 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  37.93 
 
 		 1409 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  31.62 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  35.71 
 
 		 644 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  28.17 
 
 		 2192 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  27.27 
 
 		 565 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  37.04 
 
 		 588 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  36.78 
 
 		 638 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  26.38 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1024 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  62.16 
 
 		 876 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.28 
 
 		 1412 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  32.86 
 
 		 1476 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.89 
 
 		 694 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  40.22 
 
 		 951 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  44.19 
 
 		 458 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  61.76 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  43.84 
 
 		 965 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>