54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2876 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 512 aa  1041    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.9 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  47.7 
 
 		 502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  40.04 
 
 		 520 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  39.86 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  32.52 
 
 		 505 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  30.34 
 
 		 513 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  29.3 
 
 		 563 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  26.42 
 
 		 665 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  26.45 
 
 		 677 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  26.75 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  28.71 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  30 
 
 		 368 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.04 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.63 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  25.05 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  25.45 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.8 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1066 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  28.09 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1929  hypothetical protein  30.25 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  37.61 
 
 		 341 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2354  hypothetical protein  26.13 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  25.4 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  29.06 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  27.53 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  27.56 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1024 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  27.75 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  30.77 
 
 		 653 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  27.81 
 
 		 439 aa  53.5  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  38.53 
 
 		 965 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1945  hypothetical protein  26.82 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  37.74 
 
 		 689 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  27.27 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  37.04 
 
 		 653 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  38.57 
 
 		 1092 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  36.49 
 
 		 644 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.24 
 
 		 789 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  41.25 
 
 		 799 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  32.04 
 
 		 750 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  55.56 
 
 		 507 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  36.62 
 
 		 1332 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.27 
 
 		 905 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.77 
 
 		 694 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  44.23 
 
 		 852 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  35.24 
 
 		 951 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  25.7 
 
 		 966 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1282  hypothetical protein  30.65 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  27.56 
 
 		 458 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  35.14 
 
 		 638 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2210  hypothetical protein  42.55 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02980  hypothetical protein  29.83 
 
 		 606 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  24.44 
 
 		 2972 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>