More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1748 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
759 aa  1499    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  83.84 
 
 
677 aa  880    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  70.05 
 
 
1066 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.71 
 
 
428 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.5 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  37.12 
 
 
648 aa  178  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  40.41 
 
 
745 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.23 
 
 
463 aa  168  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  49.55 
 
 
2911 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  51.56 
 
 
833 aa  151  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  44.15 
 
 
1884 aa  151  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  43.48 
 
 
1079 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  46.7 
 
 
2097 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  44.32 
 
 
1390 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  38.98 
 
 
2836 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  48.83 
 
 
4800 aa  135  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  47.26 
 
 
1112 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  36.25 
 
 
768 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  45 
 
 
1544 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  43.72 
 
 
1112 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.63 
 
 
260 aa  122  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.68 
 
 
1145 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  39.47 
 
 
2775 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  44.12 
 
 
1971 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.59 
 
 
2678 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  35.93 
 
 
2133 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  35.45 
 
 
1610 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  42.02 
 
 
1202 aa  114  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.22 
 
 
1712 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  38.25 
 
 
1610 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  35.5 
 
 
2198 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  37.7 
 
 
1628 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.08 
 
 
556 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  39.47 
 
 
1164 aa  107  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.92 
 
 
621 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  38.92 
 
 
621 aa  107  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  37.73 
 
 
1286 aa  107  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  41.23 
 
 
1582 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  35.74 
 
 
535 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.47 
 
 
2667 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  46.91 
 
 
764 aa  104  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  33.24 
 
 
1133 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  40.61 
 
 
4687 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  37.1 
 
 
2567 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  48.77 
 
 
2887 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.04 
 
 
1424 aa  101  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  33.23 
 
 
727 aa  101  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.68 
 
 
588 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.13 
 
 
1236 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  35.36 
 
 
535 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  41.8 
 
 
1213 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37.89 
 
 
1883 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  32.74 
 
 
475 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
221 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.33 
 
 
2668 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  38.86 
 
 
1072 aa  95.1  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  30.59 
 
 
851 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 
1764 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  35.14 
 
 
460 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  34.21 
 
 
795 aa  94  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  36.97 
 
 
2950 aa  93.2  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.82 
 
 
820 aa  92.8  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  36.61 
 
 
709 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  28 
 
 
341 aa  93.2  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  31.71 
 
 
475 aa  92  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  39.82 
 
 
850 aa  90.9  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  33.56 
 
 
2885 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  31.18 
 
 
2701 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.75 
 
 
1963 aa  89.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.39 
 
 
3619 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.67 
 
 
3608 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.55 
 
 
1029 aa  88.6  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  34.36 
 
 
460 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.39 
 
 
3619 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  36.33 
 
 
946 aa  88.2  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  36.55 
 
 
1029 aa  88.2  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 
1895 aa  87.8  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.45 
 
 
387 aa  87.8  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.22 
 
 
3209 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  33.61 
 
 
574 aa  87.8  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  35.9 
 
 
982 aa  87.8  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.23 
 
 
1019 aa  87.4  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.36 
 
 
202 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  37.36 
 
 
202 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.38 
 
 
2954 aa  87.4  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.4 
 
 
387 aa  87  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  31.73 
 
 
437 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  39.52 
 
 
1864 aa  87  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  31.2 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  33.89 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  36.4 
 
 
2807 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.33 
 
 
1795 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.97 
 
 
2105 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
3954 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.1 
 
 
998 aa  85.1  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.43 
 
 
1180 aa  84.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  32.04 
 
 
329 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  32.04 
 
 
329 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  35.8 
 
 
757 aa  83.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.56 
 
 
813 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>