18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0233 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  48.84 
 
 		 653 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  63.44 
 
 		 644 aa  844    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  100 
 
 		 638 aa  1329    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1881  hypothetical protein  51.35 
 
 		 571 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000514477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1024 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  38.96 
 
 		 520 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.97 
 
 		 694 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1882  hypothetical protein  32.56 
 
 		 92 aa  52  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000000163845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 951 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.26 
 
 		 965 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  37.93 
 
 		 368 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  36.99 
 
 		 502 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  36.78 
 
 		 446 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  28.97 
 
 		 839 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  31.51 
 
 		 665 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.14 
 
 		 512 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.14 
 
 		 500 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.12 
 
 		 1206 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>