174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1738 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  100 
 
 		 2972 aa  6068    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  45.34 
 
 		 2980 aa  2452    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  50.22 
 
 		 1389 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  48.59 
 
 		 1371 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  44.31 
 
 		 3542 aa  219  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  38.08 
 
 		 652 aa  185  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  26.42 
 
 		 1162 aa  184  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  33.18 
 
 		 4429 aa  173  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2757  hypothetical protein  26.85 
 
 		 623 aa  103  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0366387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.07 
 
 		 650 aa  100  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.48 
 
 		 1466 aa  99  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  25.54 
 
 		 1230 aa  86.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1313 aa  84.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3837  hypothetical protein  29.49 
 
 		 453 aa  84  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  42.11 
 
 		 1140 aa  82  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  28.95 
 
 		 797 aa  80.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  40.91 
 
 		 658 aa  80.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  38.89 
 
 		 890 aa  79.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  34.21 
 
 		 1602 aa  78.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  40.66 
 
 		 1222 aa  78.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  37.78 
 
 		 694 aa  78.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  41.57 
 
 		 496 aa  77.4  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  38.89 
 
 		 885 aa  76.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  39.77 
 
 		 429 aa  75.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  38.2 
 
 		 642 aa  74.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  38.2 
 
 		 598 aa  73.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.51 
 
 		 886 aa  72.8  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  33.01 
 
 		 636 aa  72  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1245 aa  71.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1488 aa  71.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.67 
 
 		 792 aa  70.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  25.41 
 
 		 1987 aa  69.7  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  42.7 
 
 		 561 aa  68.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  37.08 
 
 		 662 aa  68.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  32.32 
 
 		 540 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  28.45 
 
 		 490 aa  67.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1351 aa  67  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  36.36 
 
 		 808 aa  66.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  32.61 
 
 		 503 aa  66.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  38.04 
 
 		 938 aa  66.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  29.17 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  31.19 
 
 		 3737 aa  66.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  40.58 
 
 		 3851 aa  66.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1287 aa  65.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  35.87 
 
 		 496 aa  64.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.36 
 
 		 1620 aa  64.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  36.79 
 
 		 4071 aa  64.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  40.91 
 
 		 2833 aa  63.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  37.63 
 
 		 3682 aa  63.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  32 
 
 		 749 aa  63.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  31.11 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.44 
 
 		 4896 aa  62.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 1606 aa  62.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  24.48 
 
 		 871 aa  61.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  24.64 
 
 		 627 aa  61.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1193 aa  61.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.78 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  36.46 
 
 		 822 aa  60.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  41.43 
 
 		 799 aa  59.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.96 
 
 		 2377 aa  59.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  29.21 
 
 		 532 aa  58.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  30 
 
 		 534 aa  58.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  36.96 
 
 		 677 aa  57.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  34.09 
 
 		 971 aa  57.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  40.85 
 
 		 637 aa  57.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1163 aa  57  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  34.41 
 
 		 968 aa  56.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  33.71 
 
 		 1018 aa  56.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  30.63 
 
 		 971 aa  55.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1064 aa  56.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  31.91 
 
 		 969 aa  55.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  28.66 
 
 		 1882 aa  55.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  31.91 
 
 		 963 aa  55.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  28.66 
 
 		 978 aa  55.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  34.85 
 
 		 640 aa  55.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  34.83 
 
 		 1463 aa  55.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 950 aa  54.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  29.09 
 
 		 3324 aa  54.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  32.97 
 
 		 967 aa  54.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  23.35 
 
 		 742 aa  54.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  36.73 
 
 		 794 aa  54.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  29.75 
 
 		 551 aa  54.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  21.91 
 
 		 315 aa  53.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1682 aa  53.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  26.52 
 
 		 2554 aa  53.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  34.41 
 
 		 1228 aa  53.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1980 aa  53.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  27.71 
 
 		 575 aa  53.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  33.66 
 
 		 929 aa  53.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  26.2 
 
 		 930 aa  53.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  31.46 
 
 		 971 aa  52.8  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  31.46 
 
 		 971 aa  52.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  34.83 
 
 		 3227 aa  53.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  31.46 
 
 		 971 aa  52.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  34.69 
 
 		 774 aa  52.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  30.68 
 
 		 971 aa  53.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  31.46 
 
 		 971 aa  53.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1547 aa  52.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  27.71 
 
 		 965 aa  52.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  35.71 
 
 		 3793 aa  52.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>