103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5223 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  100 
 
 		 1228 aa  2405    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  33.46 
 
 		 2278 aa  192  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  51.25 
 
 		 1303 aa  174  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.23 
 
 		 1606 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  47.58 
 
 		 1386 aa  153  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.73 
 
 		 1620 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 1602 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  39.88 
 
 		 1748 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  37.14 
 
 		 1160 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  43.4 
 
 		 1275 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  32.67 
 
 		 1302 aa  115  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.11 
 
 		 2270 aa  94.7  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  31.56 
 
 		 1483 aa  94.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  29.27 
 
 		 1466 aa  92.8  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.6 
 
 		 885 aa  92.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  33.11 
 
 		 662 aa  92  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  28.27 
 
 		 642 aa  91.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  40.7 
 
 		 1414 aa  89.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  30.37 
 
 		 2005 aa  89.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.5 
 
 		 890 aa  88.6  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  36 
 
 		 886 aa  88.2  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  28.24 
 
 		 797 aa  87.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  32.94 
 
 		 1108 aa  81.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.73 
 
 		 1987 aa  79  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  29.41 
 
 		 749 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1313 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  37.59 
 
 		 794 aa  76.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  25.62 
 
 		 1371 aa  74.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1287 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25.21 
 
 		 4429 aa  72.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  32.92 
 
 		 3682 aa  72  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  30.87 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  28.06 
 
 		 792 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  36.84 
 
 		 652 aa  70.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  26.48 
 
 		 3851 aa  69.3  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  31.64 
 
 		 3737 aa  68.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  28.46 
 
 		 535 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  45.45 
 
 		 691 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  42.45 
 
 		 4896 aa  65.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  36.17 
 
 		 3542 aa  65.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  27.62 
 
 		 3227 aa  65.1  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  31.19 
 
 		 496 aa  64.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.01 
 
 		 1657 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1245 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  34.07 
 
 		 637 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.41 
 
 		 627 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  26.65 
 
 		 1389 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  21.48 
 
 		 636 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.86 
 
 		 3793 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  29.13 
 
 		 938 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  23.66 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  33.66 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  31.73 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 2980 aa  58.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1184 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  31.97 
 
 		 534 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1027  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1525 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  27.14 
 
 		 799 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  25.07 
 
 		 1222 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  31.48 
 
 		 658 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  31.73 
 
 		 540 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1488 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  37.5 
 
 		 598 aa  55.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1163 aa  55.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  27.64 
 
 		 1140 aa  55.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  23.9 
 
 		 808 aa  55.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  33.7 
 
 		 1230 aa  55.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  23.81 
 
 		 2833 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  29.48 
 
 		 822 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  34.41 
 
 		 2972 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  30.49 
 
 		 640 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  30.77 
 
 		 4071 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.04 
 
 		 3471 aa  53.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  22.76 
 
 		 496 aa  53.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  30.46 
 
 		 4044 aa  52.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1259 aa  52  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  26.91 
 
 		 2927 aa  51.6  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  26 
 
 		 2267 aa  50.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  37.88 
 
 		 711 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.8 
 
 		 1679 aa  50.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  29.75 
 
 		 3958 aa  49.3  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  21.02 
 
 		 2064 aa  49.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.47 
 
 		 2367 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.47 
 
 		 2411 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  25.4 
 
 		 3927 aa  48.9  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  30.43 
 
 		 2262 aa  48.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.27 
 
 		 2402 aa  48.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.81 
 
 		 1288 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  38.71 
 
 		 1152 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  28.68 
 
 		 950 aa  48.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  25.63 
 
 		 1526 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1059 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.47 
 
 		 2807 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  21.48 
 
 		 815 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.38 
 
 		 5745 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  30.95 
 
 		 561 aa  46.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  28 
 
 		 1266 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  38.98 
 
 		 3324 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29 
 
 		 3191 aa  45.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  29.63 
 
 		 969 aa  45.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>