More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1421 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 930 aa  1830    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  47.23 
 
 		 752 aa  568  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.51 
 
 		 930 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  36.18 
 
 		 1094 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.78 
 
 		 1682 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  40.09 
 
 		 1862 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  43.82 
 
 		 978 aa  376  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  45.11 
 
 		 2272 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  37.27 
 
 		 1667 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  45.44 
 
 		 1842 aa  362  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.86 
 
 		 786 aa  361  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  46.98 
 
 		 963 aa  361  4e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  37.03 
 
 		 1282 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  49.42 
 
 		 2122 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  41.39 
 
 		 1732 aa  348  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  49.3 
 
 		 575 aa  344  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  47.33 
 
 		 735 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  48.84 
 
 		 561 aa  341  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  47.73 
 
 		 2000 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  48.83 
 
 		 1882 aa  337  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  40.92 
 
 		 1361 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  50.47 
 
 		 1356 aa  328  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  38.94 
 
 		 2036 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  36.12 
 
 		 941 aa  325  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  53.25 
 
 		 679 aa  321  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.61 
 
 		 528 aa  320  7.999999999999999e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.75 
 
 		 838 aa  320  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  50 
 
 		 859 aa  319  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  52 
 
 		 713 aa  310  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  57.23 
 
 		 676 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  41.55 
 
 		 1667 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  52.62 
 
 		 685 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.71 
 
 		 2554 aa  300  8e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  52.28 
 
 		 658 aa  299  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  51.82 
 
 		 1969 aa  293  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  49.16 
 
 		 1120 aa  293  9e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  46.14 
 
 		 530 aa  289  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  52.87 
 
 		 831 aa  287  7e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  52.29 
 
 		 387 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  49.85 
 
 		 1300 aa  282  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  48.39 
 
 		 669 aa  280  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  47.95 
 
 		 675 aa  277  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  50.17 
 
 		 668 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.01 
 
 		 1528 aa  274  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  51.54 
 
 		 460 aa  271  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  51.28 
 
 		 346 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  47.89 
 
 		 579 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  44.54 
 
 		 861 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  48.36 
 
 		 627 aa  265  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.6 
 
 		 958 aa  263  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  51.57 
 
 		 709 aa  259  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  36.06 
 
 		 1783 aa  258  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  54.47 
 
 		 581 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  47.75 
 
 		 1241 aa  255  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  39.45 
 
 		 1236 aa  254  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.01 
 
 		 343 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  56.86 
 
 		 3295 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  50.19 
 
 		 791 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  50.31 
 
 		 390 aa  243  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  51.78 
 
 		 551 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  49.45 
 
 		 547 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  38.24 
 
 		 1387 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  47.04 
 
 		 910 aa  239  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  44.7 
 
 		 840 aa  238  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  51.52 
 
 		 522 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  48.91 
 
 		 615 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  46.11 
 
 		 823 aa  234  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  45.21 
 
 		 719 aa  224  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  38.33 
 
 		 869 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  44.13 
 
 		 870 aa  221  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  39.67 
 
 		 491 aa  217  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.64 
 
 		 802 aa  217  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  39.39 
 
 		 588 aa  214  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.66 
 
 		 845 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  33.59 
 
 		 1011 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  44 
 
 		 1293 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  29.54 
 
 		 952 aa  207  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.86 
 
 		 971 aa  204  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  38.24 
 
 		 1292 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  36.22 
 
 		 392 aa  194  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.72 
 
 		 2176 aa  194  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  29.21 
 
 		 865 aa  193  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.05 
 
 		 929 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  42.44 
 
 		 777 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.79 
 
 		 443 aa  184  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.66 
 
 		 1620 aa  183  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.72 
 
 		 819 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  42.91 
 
 		 2552 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  27.54 
 
 		 1814 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  40.66 
 
 		 1380 aa  173  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  38.98 
 
 		 391 aa  173  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  53.57 
 
 		 560 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  52.98 
 
 		 644 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.21 
 
 		 1531 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  53.8 
 
 		 184 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.08 
 
 		 1189 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.4 
 
 		 1095 aa  164  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.39 
 
 		 439 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  38.62 
 
 		 821 aa  159  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  42.61 
 
 		 525 aa  158  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>