More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2368 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  52.84 
 
 		 958 aa  756    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  100 
 
 		 869 aa  1778    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  48.65 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  47.09 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  48.46 
 
 		 609 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  44.97 
 
 		 1799 aa  336  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  43.04 
 
 		 458 aa  302  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  43.56 
 
 		 1094 aa  260  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  43.38 
 
 		 752 aa  255  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  42.33 
 
 		 859 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  44.64 
 
 		 1882 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  41.93 
 
 		 679 aa  254  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.77 
 
 		 685 aa  252  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  44.58 
 
 		 2036 aa  252  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.99 
 
 		 735 aa  251  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  43.56 
 
 		 713 aa  251  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  43.87 
 
 		 1682 aa  251  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  42.93 
 
 		 675 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  44.28 
 
 		 1842 aa  250  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  38.55 
 
 		 684 aa  248  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  38.66 
 
 		 1262 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  43.64 
 
 		 1300 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  44.04 
 
 		 669 aa  245  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  42.64 
 
 		 2272 aa  243  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  45.93 
 
 		 963 aa  241  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  45.05 
 
 		 1356 aa  239  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43.16 
 
 		 575 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  42.15 
 
 		 1667 aa  233  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  41.69 
 
 		 561 aa  233  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  44.92 
 
 		 658 aa  232  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  44.55 
 
 		 930 aa  231  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  42.77 
 
 		 978 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  41.96 
 
 		 2122 aa  227  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  42.15 
 
 		 1862 aa  226  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  40.79 
 
 		 528 aa  225  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  42.77 
 
 		 1969 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  41.99 
 
 		 2000 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  38.86 
 
 		 930 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  41.47 
 
 		 1361 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  43.29 
 
 		 1241 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  41.41 
 
 		 2554 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  39.27 
 
 		 1282 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.52 
 
 		 1120 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  39.59 
 
 		 861 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  41.5 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  41.03 
 
 		 460 aa  207  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  46.32 
 
 		 791 aa  204  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  47.23 
 
 		 547 aa  202  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.33 
 
 		 838 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  46.15 
 
 		 581 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  37.22 
 
 		 1528 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  39.08 
 
 		 941 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  45.95 
 
 		 1732 aa  191  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  31.86 
 
 		 486 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  31.46 
 
 		 550 aa  184  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  45.28 
 
 		 3295 aa  184  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  41.83 
 
 		 615 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  42.27 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  43.41 
 
 		 1236 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  38.68 
 
 		 1667 aa  181  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  38.14 
 
 		 2176 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  37.72 
 
 		 971 aa  177  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  42.97 
 
 		 910 aa  177  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36.66 
 
 		 840 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  37.15 
 
 		 870 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  38.76 
 
 		 1387 aa  169  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  37.39 
 
 		 823 aa  168  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.07 
 
 		 845 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  36.49 
 
 		 719 aa  164  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  35.67 
 
 		 1292 aa  164  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  37.32 
 
 		 802 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  36.02 
 
 		 929 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  30.22 
 
 		 857 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  38.68 
 
 		 777 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.14 
 
 		 1011 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  31.98 
 
 		 865 aa  151  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  36.57 
 
 		 443 aa  151  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  37.06 
 
 		 1814 aa  151  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  39.82 
 
 		 1095 aa  149  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.17 
 
 		 819 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  39.67 
 
 		 786 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  41.94 
 
 		 184 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  33.24 
 
 		 439 aa  140  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  30.23 
 
 		 916 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  41.4 
 
 		 2552 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  33.84 
 
 		 952 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  42.59 
 
 		 644 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  44.58 
 
 		 560 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  44.77 
 
 		 1931 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  47.17 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  42.57 
 
 		 1056 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 1620 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  53.33 
 
 		 488 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.52 
 
 		 1606 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  35.71 
 
 		 1189 aa  124  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.68 
 
 		 938 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  28.61 
 
 		 494 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  37.8 
 
 		 821 aa  118  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  44 
 
 		 500 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  33.63 
 
 		 1531 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>