More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0100 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1667 aa  3263    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1667 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  42.2 
 
 		 1862 aa  473  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  44.35 
 
 		 1094 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.78 
 
 		 2272 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  43.79 
 
 		 1361 aa  442  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  41.23 
 
 		 941 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  43.77 
 
 		 1682 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  45.15 
 
 		 963 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  48.04 
 
 		 1842 aa  365  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.63 
 
 		 1282 aa  364  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.51 
 
 		 1528 aa  358  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  43.98 
 
 		 561 aa  351  6e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  48.67 
 
 		 752 aa  345  5e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  45.69 
 
 		 978 aa  344  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  40.16 
 
 		 1783 aa  336  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.88 
 
 		 2176 aa  333  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  45.42 
 
 		 735 aa  325  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  32.22 
 
 		 1387 aa  324  9.000000000000001e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  47.86 
 
 		 958 aa  315  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  47.06 
 
 		 2036 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.71 
 
 		 930 aa  308  6e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  45.2 
 
 		 575 aa  308  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  31.98 
 
 		 1011 aa  307  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  47.27 
 
 		 1882 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  38.34 
 
 		 838 aa  304  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  30.47 
 
 		 1814 aa  300  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  47.02 
 
 		 2000 aa  295  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.2 
 
 		 1620 aa  295  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  45.71 
 
 		 2122 aa  292  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  37.61 
 
 		 1236 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  44.72 
 
 		 530 aa  281  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  45.7 
 
 		 859 aa  278  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  46.53 
 
 		 1356 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50.13 
 
 		 2554 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  45.35 
 
 		 528 aa  276  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  46.57 
 
 		 675 aa  269  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  46.38 
 
 		 1300 aa  268  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  46.22 
 
 		 713 aa  267  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  46.99 
 
 		 679 aa  266  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  47.52 
 
 		 1241 aa  263  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  32.68 
 
 		 865 aa  263  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  45.67 
 
 		 685 aa  263  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  45.95 
 
 		 1120 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  46.57 
 
 		 658 aa  258  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  46.53 
 
 		 669 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  45.54 
 
 		 1969 aa  255  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  31.34 
 
 		 952 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  42.65 
 
 		 861 aa  229  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  35.08 
 
 		 1606 aa  225  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  46.42 
 
 		 460 aa  220  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  47.06 
 
 		 551 aa  219  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  49.39 
 
 		 581 aa  218  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  47.15 
 
 		 547 aa  215  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  45.09 
 
 		 791 aa  214  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.4 
 
 		 1602 aa  212  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  47.95 
 
 		 910 aa  212  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  49.32 
 
 		 1732 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  47.18 
 
 		 615 aa  203  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.85 
 
 		 3295 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  44.1 
 
 		 443 aa  200  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  40.16 
 
 		 930 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  41.91 
 
 		 971 aa  197  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.23 
 
 		 1531 aa  194  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  39.1 
 
 		 1292 aa  193  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.89 
 
 		 870 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  40.46 
 
 		 802 aa  184  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.34 
 
 		 869 aa  184  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.83 
 
 		 929 aa  182  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.33 
 
 		 823 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  33.46 
 
 		 734 aa  182  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.77 
 
 		 845 aa  181  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.23 
 
 		 840 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.11 
 
 		 719 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.45 
 
 		 786 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.6 
 
 		 1371 aa  163  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  41.54 
 
 		 2552 aa  162  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.29 
 
 		 1095 aa  162  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  36.77 
 
 		 1987 aa  160  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.35 
 
 		 777 aa  159  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  34.83 
 
 		 684 aa  159  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  30.44 
 
 		 1389 aa  158  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  50 
 
 		 560 aa  155  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.19 
 
 		 819 aa  154  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  48.77 
 
 		 644 aa  149  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  43.13 
 
 		 938 aa  148  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  53.99 
 
 		 519 aa  142  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  33.74 
 
 		 1380 aa  142  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  49.69 
 
 		 184 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.63 
 
 		 1189 aa  139  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.97 
 
 		 500 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  42.86 
 
 		 816 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.44 
 
 		 1466 aa  135  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.08 
 
 		 439 aa  135  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  48 
 
 		 1231 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  34.12 
 
 		 517 aa  133  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  38.43 
 
 		 408 aa  133  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  31.21 
 
 		 1162 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  45.86 
 
 		 1931 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  46.82 
 
 		 996 aa  127  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>