More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2427 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2426  PKD  45.29 
 
 
1814 aa  1095    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  100 
 
 
2176 aa  4474    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  34.19 
 
 
1667 aa  386  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.54 
 
 
1094 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  34.23 
 
 
1361 aa  362  6e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  36.26 
 
 
2272 aa  338  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  34.13 
 
 
1862 aa  338  7e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.45 
 
 
1667 aa  318  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  31.04 
 
 
1387 aa  308  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  35.9 
 
 
1682 aa  278  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  35.52 
 
 
963 aa  276  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  29.98 
 
 
1282 aa  264  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  32.26 
 
 
941 aa  263  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  28.6 
 
 
1528 aa  257  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  30.66 
 
 
1783 aa  246  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.43 
 
 
1842 aa  244  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  35.97 
 
 
978 aa  243  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  34.28 
 
 
561 aa  242  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.02 
 
 
1606 aa  234  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.34 
 
 
1620 aa  228  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.97 
 
 
2554 aa  223  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  36.32 
 
 
752 aa  223  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  37.02 
 
 
1882 aa  222  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  37.19 
 
 
528 aa  218  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.54 
 
 
735 aa  218  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  30.13 
 
 
1011 aa  217  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  35.98 
 
 
2036 aa  210  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  36.15 
 
 
2000 aa  210  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  35.75 
 
 
575 aa  209  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  29.84 
 
 
952 aa  209  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.07 
 
 
859 aa  209  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  38.28 
 
 
1356 aa  206  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  36.41 
 
 
2122 aa  206  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  34.7 
 
 
958 aa  206  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  37.41 
 
 
530 aa  205  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  38.86 
 
 
675 aa  198  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  39.47 
 
 
1300 aa  197  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  32.58 
 
 
838 aa  195  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  34.09 
 
 
1236 aa  189  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  36.93 
 
 
713 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  38.28 
 
 
1969 aa  186  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  37.61 
 
 
679 aa  186  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  37.96 
 
 
669 aa  182  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  36.64 
 
 
1120 aa  181  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.51 
 
 
930 aa  181  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  36.52 
 
 
861 aa  181  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  38.14 
 
 
869 aa  181  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.02 
 
 
1602 aa  180  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  38.84 
 
 
685 aa  178  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  39.49 
 
 
1241 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  38.08 
 
 
658 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  29.08 
 
 
865 aa  164  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  37.01 
 
 
460 aa  160  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  40.62 
 
 
910 aa  157  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  40.7 
 
 
581 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  41.06 
 
 
3295 aa  154  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  28.83 
 
 
734 aa  152  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  39.85 
 
 
791 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  38.82 
 
 
547 aa  149  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  40.23 
 
 
1732 aa  146  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.26 
 
 
615 aa  146  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  38.93 
 
 
551 aa  146  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.86 
 
 
1371 aa  145  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  34.67 
 
 
443 aa  141  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27 
 
 
1531 aa  135  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.63 
 
 
971 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  33.86 
 
 
929 aa  134  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  31.04 
 
 
719 aa  133  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36.53 
 
 
930 aa  131  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.38 
 
 
1565 aa  127  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  38.26 
 
 
1095 aa  127  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  33.02 
 
 
1292 aa  126  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  30.79 
 
 
517 aa  125  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  31.16 
 
 
870 aa  123  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  31.75 
 
 
823 aa  122  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.68 
 
 
845 aa  122  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  26.28 
 
 
1389 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  31.53 
 
 
802 aa  120  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  31.5 
 
 
840 aa  119  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  27.69 
 
 
1987 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  25.87 
 
 
1057 aa  118  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.61 
 
 
1466 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.6 
 
 
777 aa  116  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  34.14 
 
 
2552 aa  111  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  40.13 
 
 
560 aa  111  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 
819 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  35.11 
 
 
500 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  29.61 
 
 
1916 aa  111  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  34.72 
 
 
650 aa  109  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  33.06 
 
 
786 aa  108  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  36.9 
 
 
644 aa  107  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  27.66 
 
 
1162 aa  107  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  31.09 
 
 
439 aa  106  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  41.88 
 
 
184 aa  104  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.58 
 
 
1189 aa  102  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  30.83 
 
 
684 aa  101  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  31.53 
 
 
821 aa  100  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.98 
 
 
623 aa  97.8  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  36.49 
 
 
519 aa  97.8  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  26.72 
 
 
1463 aa  97.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>