263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1069 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 1783 aa  3456    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  40.26 
 
 		 1094 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1667 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  37.92 
 
 		 1361 aa  425  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  37.94 
 
 		 2272 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  35.27 
 
 		 1862 aa  386  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.27 
 
 		 1667 aa  342  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1682 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  40.21 
 
 		 963 aa  333  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  34.51 
 
 		 941 aa  326  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  32.1 
 
 		 1528 aa  314  9e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  37.95 
 
 		 910 aa  295  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  42.03 
 
 		 752 aa  294  8e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  39.41 
 
 		 978 aa  287  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1282 aa  285  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  38.88 
 
 		 561 aa  285  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  38.56 
 
 		 1842 aa  282  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  38.67 
 
 		 735 aa  277  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  39.9 
 
 		 1236 aa  276  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.76 
 
 		 2554 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.92 
 
 		 2176 aa  265  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  41.05 
 
 		 575 aa  260  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  33.68 
 
 		 1387 aa  258  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40.52 
 
 		 1882 aa  255  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  40.21 
 
 		 528 aa  253  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  30.81 
 
 		 1814 aa  253  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  41.61 
 
 		 530 aa  252  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  40 
 
 		 2122 aa  251  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.22 
 
 		 2036 aa  250  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  43.24 
 
 		 859 aa  251  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  43.87 
 
 		 675 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  39.19 
 
 		 2000 aa  246  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35.77 
 
 		 930 aa  244  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  43.22 
 
 		 713 aa  243  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  43.3 
 
 		 679 aa  241  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  44.44 
 
 		 658 aa  237  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  43.47 
 
 		 669 aa  236  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  31 
 
 		 1011 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  41.1 
 
 		 1356 aa  232  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  43.6 
 
 		 1300 aa  229  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  43.59 
 
 		 685 aa  229  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  41.07 
 
 		 1241 aa  229  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  43.05 
 
 		 1969 aa  229  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.01 
 
 		 1120 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  30.25 
 
 		 952 aa  215  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  40.6 
 
 		 460 aa  207  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  37.48 
 
 		 958 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.48 
 
 		 1620 aa  196  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  44.32 
 
 		 581 aa  194  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  42.9 
 
 		 1732 aa  189  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.4 
 
 		 861 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.65 
 
 		 791 aa  181  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  28.3 
 
 		 865 aa  179  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  42.28 
 
 		 547 aa  178  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  42.09 
 
 		 615 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  38.26 
 
 		 930 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  42.26 
 
 		 551 aa  175  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.89 
 
 		 1602 aa  174  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 3295 aa  168  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  31.74 
 
 		 838 aa  166  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  32.37 
 
 		 1531 aa  165  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.72 
 
 		 1606 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  33.06 
 
 		 1292 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  33.56 
 
 		 2552 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  37.03 
 
 		 971 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  33.42 
 
 		 719 aa  142  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  32.5 
 
 		 840 aa  141  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.04 
 
 		 940 aa  139  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  45.45 
 
 		 560 aa  138  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  44.44 
 
 		 644 aa  138  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  37.75 
 
 		 443 aa  135  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.67 
 
 		 1389 aa  135  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  34.71 
 
 		 823 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.31 
 
 		 845 aa  133  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  37.26 
 
 		 882 aa  132  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.69 
 
 		 802 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  42.29 
 
 		 184 aa  129  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  46.78 
 
 		 519 aa  129  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.78 
 
 		 1371 aa  128  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.8 
 
 		 938 aa  127  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.42 
 
 		 870 aa  126  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.41 
 
 		 777 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  36.88 
 
 		 786 aa  119  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.25 
 
 		 929 aa  119  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  30.96 
 
 		 869 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  43.95 
 
 		 500 aa  116  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  35.6 
 
 		 1095 aa  116  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.3 
 
 		 1987 aa  116  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  29.12 
 
 		 821 aa  115  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  36.92 
 
 		 819 aa  115  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  41.05 
 
 		 816 aa  115  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  27.95 
 
 		 734 aa  113  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  44.44 
 
 		 996 aa  112  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  32.83 
 
 		 1380 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  37.56 
 
 		 1231 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  30.56 
 
 		 439 aa  109  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.07 
 
 		 1466 aa  109  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  45.06 
 
 		 1328 aa  108  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  38.58 
 
 		 1931 aa  104  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  35.27 
 
 		 848 aa  103  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>